Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms