Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms