Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34c1Q8K193 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34c1Q8K193 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34c1Q8K193 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34c1Q8K193 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34c1Q8K193 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34c1Q8K193 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34c1Q8K193 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34c1Q8K193 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34c1Q8K193 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms