Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H7

Slc45a3, Solute carrier family 45 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a3Q8K0H7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc45a3Q8K0H7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc45a3Q8K0H7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms