Protein–RNA interactions for Protein: Q8K039

Uncharacterized protein KIAA1143 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8K039 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8K039 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8K039 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8K039 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8K039 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8K039 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8K039 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8K039 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8K039 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8K039 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8K039 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8K039 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8K039 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8K039 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8K039 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8K039 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8K039 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8K039 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8K039 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8K039 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8K039 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8K039 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8K039 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8K039 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8K039 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8K039 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8K039 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8K039 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8K039 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8K039 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8K039 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8K039 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8K039 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8K039 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8K039 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8K039 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8K039 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8K039 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8K039 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8K039 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8K039 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8K039 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8K039 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8K039 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8K039 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8K039 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8K039 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8K039 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8K039 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8K039 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8K039 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8K039 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8K039 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8K039 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8K039 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8K039 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8K039 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8K039 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8K039 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8K039 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8K039 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8K039 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8K039 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8K039 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8K039 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8K039 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8K039 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8K039 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8K039 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8K039 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8K039 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8K039 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8K039 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8K039 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8K039 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8K039 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms