Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trip10Q8CJ53 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms