Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CopaQ8CIE6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms