Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms