Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHQ0

Fbxo4, F-box only protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo4Q8CHQ0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms