Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Csnka2ipQ8CH19 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnka2ipQ8CH19 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms