Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms