Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Setd1bQ8CFT2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Setd1bQ8CFT2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms