Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

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Length 1,004 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4lQ8CFI0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4lQ8CFI0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4lQ8CFI0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4lQ8CFI0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Nedd4lQ8CFI0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Nedd4lQ8CFI0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Nedd4lQ8CFI0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4lQ8CFI0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4lQ8CFI0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Nedd4lQ8CFI0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Nedd4lQ8CFI0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Nedd4lQ8CFI0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Nedd4lQ8CFI0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Nedd4lQ8CFI0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd4lQ8CFI0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd4lQ8CFI0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Nedd4lQ8CFI0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4lQ8CFI0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Nedd4lQ8CFI0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Nedd4lQ8CFI0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Nedd4lQ8CFI0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Nedd4lQ8CFI0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Nedd4lQ8CFI0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4lQ8CFI0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4lQ8CFI0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4lQ8CFI0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4lQ8CFI0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4lQ8CFI0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4lQ8CFI0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4lQ8CFI0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd4lQ8CFI0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd4lQ8CFI0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms