Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Hpf1Q8CFE2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Hpf1Q8CFE2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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