Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms