Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE47

Slc49a3, Solute carrier family 49 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc49a3Q8CE47 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms