Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc17Q8CE13 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms