Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc87Q8CDL9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms