Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms