Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms