Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spef2Q8C9J3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spef2Q8C9J3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms