Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms