Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg16l1Q8C0J2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms