Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp47Q8BY87 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
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