Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrtm1Q8BXQ3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrtm1Q8BXQ3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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