Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trerf1Q8BXJ2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms