Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ctdsp2Q8BX07 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ctdsp2Q8BX07 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdsp2Q8BX07 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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