Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU47

E330017A01Rik, Ferritin, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330017A01RikQ8BU47 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330017A01RikQ8BU47 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E330017A01RikQ8BU47 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E330017A01RikQ8BU47 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E330017A01RikQ8BU47 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E330017A01RikQ8BU47 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E330017A01RikQ8BU47 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E330017A01RikQ8BU47 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E330017A01RikQ8BU47 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330017A01RikQ8BU47 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330017A01RikQ8BU47 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
E330017A01RikQ8BU47 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330017A01RikQ8BU47 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330017A01RikQ8BU47 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330017A01RikQ8BU47 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330017A01RikQ8BU47 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330017A01RikQ8BU47 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
E330017A01RikQ8BU47 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330017A01RikQ8BU47 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330017A01RikQ8BU47 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms