Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup54Q8BTS4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms