Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjd4Q8BSD4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjd4Q8BSD4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjd4Q8BSD4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjd4Q8BSD4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjd4Q8BSD4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjd4Q8BSD4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjd4Q8BSD4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjd4Q8BSD4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjd4Q8BSD4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjd4Q8BSD4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjd4Q8BSD4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjd4Q8BSD4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjd4Q8BSD4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gjd4Q8BSD4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjd4Q8BSD4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms