Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.6 ms