Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP97

Rhbdd3, Rhomboid domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd3Q8BP97 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rhbdd3Q8BP97 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rhbdd3Q8BP97 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rhbdd3Q8BP97 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rhbdd3Q8BP97 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rhbdd3Q8BP97 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rhbdd3Q8BP97 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd3Q8BP97 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd3Q8BP97 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd3Q8BP97 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd3Q8BP97 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd3Q8BP97 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd3Q8BP97 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd3Q8BP97 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd3Q8BP97 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd3Q8BP97 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd3Q8BP97 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd3Q8BP97 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms