Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap4Q8BMK4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap4Q8BMK4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap4Q8BMK4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap4Q8BMK4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap4Q8BMK4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap4Q8BMK4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap4Q8BMK4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap4Q8BMK4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap4Q8BMK4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap4Q8BMK4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap4Q8BMK4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap4Q8BMK4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap4Q8BMK4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap4Q8BMK4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap4Q8BMK4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms