Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hirip3Q8BLH7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms