Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms