Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc38a9Q8BGD6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a9Q8BGD6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms