Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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H2-M10.3Q85ZW6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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H2-M10.3Q85ZW6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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