Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Atg4cQ811C2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Atg4cQ811C2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Atg4cQ811C2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Atg4cQ811C2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Atg4cQ811C2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Atg4cQ811C2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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