Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc50Q810U5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms