Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

Predictions only

Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pkhd1l1Q80ZA4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms