Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2bQ80XK6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2bQ80XK6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg2bQ80XK6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg2bQ80XK6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg2bQ80XK6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg2bQ80XK6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg2bQ80XK6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg2bQ80XK6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg2bQ80XK6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg2bQ80XK6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg2bQ80XK6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg2bQ80XK6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg2bQ80XK6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Atg2bQ80XK6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg2bQ80XK6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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