Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ttc28Q80XJ3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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