Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
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Pcsk9Q80W65 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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