Protein–RNA interactions for Protein: Q80VU4

Ntf4, Neurotrophin-4, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf4Q80VU4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntf4Q80VU4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms