Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc155Q80VJ8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms