Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cep170bQ80U49 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cep170bQ80U49 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cep170bQ80U49 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cep170bQ80U49 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cep170bQ80U49 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cep170bQ80U49 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cep170bQ80U49 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cep170bQ80U49 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cep170bQ80U49 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep170bQ80U49 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms