Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf7ipQ7TT18 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms