Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lamp3Q7TST5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms