Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek5Q7TSC3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek5Q7TSC3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek5Q7TSC3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek5Q7TSC3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek5Q7TSC3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek5Q7TSC3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek5Q7TSC3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek5Q7TSC3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek5Q7TSC3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek5Q7TSC3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek5Q7TSC3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek5Q7TSC3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek5Q7TSC3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek5Q7TSC3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms