Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms